Bawang merah memiliki struktur yang berlapis-lapis sampai ke bagian tengahnya ketika dibelah.
Struktur tersebut berada pada organ vegetatif seperti bawang merah disebut umbi lapis.
Umbi lapis terjadi pada tumbuhan monokotil. Selain itu, umbi lapis tmemiliki lima bagian utama, antara lain:
1. Pelat basah (terdapat pada bagian bawah umbi yang berfungsi sebagai tempat tumbuh akar)
2. Sisik (merupakan jaringan penyimpanan utama)
3. Tunik (bagian penutup sisik berdaging)
4. Pucuk (tempat kuncup bunga yang berkembang)
5. Tunas lateral