Ia lalu dibebaskan dari jabatan kapten dan digantikan oleh Christopher Schindler.
Setelah musim 2014-15, Julian Weigl ditransfer ke Borussia Dortmund dan menandatangani kontraknya sampai 2019.
Ia kemudian melakukan debutnya di Dortmund pada 15 Agustus 2015 dalam kemenangan kandang 4-0 melawan Borussia Mönchengladbach.
Julian Weigl debut di Liga Eropa sebulan setelahnya dan saat ia masuk di menit ke-60 sebagai pemain pengganti melawan FC Krasnodar.
Permainan yang luar biasa itu membuat Julian Weigl mendapatkan tempat awal di Dortmund.
Ia juga membantu mereka hingga ke finis kedua Bundesliga dan bermain secara teratur di Dortmund sebelum tersingkirkan Liverpool.
Julian Weigl lalu mencetak gol pertamanya untuk Dortmund yang merupakan gol profesional pertamanya melawan Sporting CP diLiga Champions UEFA
Ia mencetak gol kemenangan dari luar kotak dalam kemenangan 2-1.
Kemudian, Julian Weigl menandatangani kontrak baru dengan Borussia pada 21 Desember, membuatnya tetap di klub hingga 2021.
Pada 31 Desember 2019, Benefica umumkan kesepakatan dengan Dortmund untuk menandatangani Julian Weigl.
Pada 2 Januari 2020, Julian Weigl tiba di Lisbon dan melakukan pemeriksaan fisik sebelum mengenal stadion barunya dan menandatangani kontrak hingga Juni 2024.
Baca Juga: Profil Timnas Jerman: Matthias Ginter, Pemain Gelandang di Borussia Monchengladbach